داستان انیمه درباره یک نینجای سابق به نام "جو لوگان" است که از قبیله خود و گذشته خشونت‌آمیزش فرار کرده و در دهکده‌ای در آمریکا پنهان می‌شود. اما در این میان گروهی از قاتلان به دلیل خیانت جو لوگان به قبیله، برای گرفتن انتقامی خونین به سراغ او و خانواده‌اش می‌روند. پس از حمله، جو برای گرفتن انتقام مرگ خانواده‌اش در قالب یک نینجا معروف به نینجا کامویی ظاهر می‌شود تا همان قبیله‌ای که روزی در آن زندگی می‌کرد را نابود کند و ...